De twee belangrijkste luchthavens
De luchthaven van Heraklion (HER), officieel Nikos Kazantzakis Airport, is de drukste luchthaven van Kreta en de op één na drukste van Griekenland, na Athene. De luchthaven ligt aan de noordkust, ongeveer 5 kilometer ten oosten van de stad Heraklion, en is het hele jaar door geopend, met dagelijkse verbindingen naar Athene en een breed scala aan rechtstreekse Europese vluchten tijdens het seizoen. Het is de meest geschikte toegangspoort tot Centraal- en Oost-Kreta, met inbegrip van Heraklion zelf, Hersonissos, Malia, Agios Nikolaos, Elounda en Sitia.
De luchthaven van Chania (CHQ), officieel Ioannis Daskalogiannis Airport, ligt op het schiereiland Akrotiri, ongeveer 14 kilometer ten oosten van de stad Chania. Er worden het hele jaar door binnenlandse vluchten uitgevoerd naar Athene, Thessaloniki en andere Griekse luchthavens, met een groot aantal rechtstreekse internationale en chartervluchten vanuit heel Europa tussen ongeveer april en november. Dit is de betere keuze voor West-Kreta, met inbegrip van Chania, Rethymno, de Samaria-kloof en stranden zoals Balos, Falassarna en Elafonissi.
Het is vermeldenswaard dat er een nieuwe luchthaven in aanbouw is in Kasteli, ten zuidoosten van Heraklion, die in de toekomst de regio moet bedienen.